Agents of pneumonia in slaughtered pigs in southern Brazil

ABSTRACT: A high prevalence of pneumonic lesions has been reported to affect slaughtered pigs in southern Brazil. In order to identify which microorganisms have been causing those lesions, 30 pig lungs presenting pneumonic gross lesions were collected from five different slaughterhouses, totaling 150 lungs. Samples for bacterial isolation, molecular, histopathologic and immunohistochemistry (IHC) evaluation were taken from each lung. The pneumonic lesion scoring ranged from 1.53 to 2.83. The most frequent histopathological lesions found was the concomitant Influenza A virus (IAV) and Mycoplasma hyopneumoniae infection, corresponding to 55.3% (83/150), and Pasteurella multocida type A was isolated in 54.2% (45/83) of these cases. In 102 samples (68%), there was histopathologic suggestion of involvement of more than one infectious agent. M. hyopneumoniae was the most frequent agent associated with pneumonic lesions, being present in 92.1% (94/102) of the lungs with coinfections, followed by IAV in 89.2% (91/102). Besides the coinfections, IAV lesions were observed also in six samples without another pathogenic microorganism detected. A total of 46 samples with acute and subacute IAV suspected lesions in histopathological examination were assessed for IHC and real time RT-PCR for IAV. A total of 35% (16/46) of them were positive by IHC and 13% (6/46) by real time RT-PCR. Regarding M. hyopneumoniae, 79.3% (119/150) of samples were positive by qPCR and 84.9% (101/119) of them also presented M. hyopneumoniae suspected lesions in the histopathological examination. The results of this study suggest the importance of IAV in respiratory diseases in finishing pigs, even though this virus is more frequently reported in the nursery phase. In addition, our results emphasize the importance of lung coinfections in finishing pigs.

RESUMO: Lesões sugestivas de pneumonia são frequentemente encontradas em altas prevalências em suínos abatidos no sul do Brasil. Para identificar quais microrganismos causam essas lesões, foram coletados 30 pulmões de suínos com lesão macroscópica sugestiva de pneumonia em cinco frigoríficos diferentes, totalizando 150 pulmões. Amostras para isolamento bacteriano, avaliação molecular, histopatológica e imuno-histoquímica (IHC) foram coletadas de cada pulmão. O escore de lesão pulmonar variou entre 1,53 a 2,83. O achado histopatológico mais observado foi a lesão sugestiva de infecção concomitante pelo vírus Influenza A (IAV) e Mycoplasma (M.) hyopneumoniae, correspondendo a 55,3% (83/150), e em 54,2% (45/83) desses casos Pasteurella (P.) multocida tipo A foi isolado. Em 102 amostras (68%), houve lesão histopatológica sugestiva do envolvimento de mais de um agente infeccioso. M. hyopneumoniae foi o microrganismo mais frequente associado a lesões de pneumonia, estando presente em 92,1% (94/102) dos pulmões com coinfecções, seguido de IAV, que foi encontrado em 89,2% (91/102). Além das coinfecções, lesões de IAV foram observadas em mais seis amostras que não aparentavam envolvimento de outro agente infeccioso. Um total de 46 amostras com suspeita de lesão aguda e subaguda de IAV no exame histopatológico foram avaliadas para IHC e RT-PCR em tempo real para IAV e 35% (16/46) delas foram positivas por IHC e 13% (6/46) foram positivas por RT-PCR em tempo real. Com relação a M. hyopneumoniae, 79,3% (119/150) das amostras foram positivas por qPCR e 84,9% (101/119) delas também apresentaram lesões suspeitas de M. hyopneumoniae no exame histopatológico. Os resultados deste trabalho sugerem a importância do IAV como agente causador de pneumonias em suínos de terminação, embora esse vírus seja mais frequentemente relatado na fase de creche. Além disso, os achados deste trabalho demonstram a presença frequente de coinfecções pulmonares em suínos de terminação.

Agents of pneumonia in slaughtered pigs in southern Brazil / Agentes patogênicos de pneumonia em suínos abatidos no sul do Brasil

A high prevalence of pneumonic lesions has been reported to affect slaughtered pigs in southern Brazil. In order to identify which microorganisms have been causing those lesions, 30 pig lungs presenting pneumonic gross lesions were collected from five different slaughterhouses, totaling 150 lungs. Samples for bacterial isolation, molecular, histopathologic and immunohistochemistry (IHC) evaluation were taken from each lung. The pneumonic lesion scoring ranged from 1.53 to 2.83. The most frequent histopathological lesions found was the concomitant Influenza A virus (IAV) and Mycoplasma hyopneumoniae infection, corresponding to 55.3% (83/150), and Pasteurella multocida type A was isolated in 54.2% (45/83) of these cases. In 102 samples (68%), there was histopathologic suggestion of involvement of more than one infectious agent. M. hyopneumoniae was the most frequent agent associated with pneumonic lesions, being present in 92.1% (94/102) of the lungs with coinfections, followed by IAV in 89.2% (91/102). Besides the coinfections, IAV lesions were observed also in six samples without another pathogenic microorganism detected. A total of 46 samples with acute and subacute IAV suspected lesions in histopathological examination were assessed for IHC and real time RT-PCR for IAV. A total of 35% (16/46) of them were positive by IHC and 13% (6/46) by real time RT-PCR. Regarding M. hyopneumoniae, 79.3% (119/150) of samples were positive by qPCR and 84.9% (101/119) of them also presented M. hyopneumoniae suspected lesions in the histopathological examination. The results of this study suggest the importance of IAV in respiratory diseases in finishing pigs, even though this virus is more frequently reported in the nursery phase. In addition, our results emphasize the importance of lung coinfections in finishing pigs.(AU)

Lesões sugestivas de pneumonia são frequentemente encontradas em altas prevalências em suínos abatidos no sul do Brasil. Para identificar quais microrganismos causam essas lesões, foram coletados 30 pulmões de suínos com lesão macroscópica sugestiva de pneumonia em cinco frigoríficos diferentes, totalizando 150 pulmões. Amostras para isolamento bacteriano, avaliação molecular, histopatológica e imuno-histoquímica (IHC) foram coletadas de cada pulmão. O escore de lesão pulmonar variou entre 1,53 a 2,83. O achado histopatológico mais observado foi a lesão sugestiva de infecção concomitante pelo vírus Influenza A (IAV) e Mycoplasma (M.) hyopneumoniae, correspondendo a 55,3% (83/150), e em 54,2% (45/83) desses casos Pasteurella (P.) multocida tipo A foi isolado. Em 102 amostras (68%), houve lesão histopatológica sugestiva do envolvimento de mais de um agente infeccioso. M. hyopneumoniae foi o microrganismo mais frequente associado a lesões de pneumonia, estando presente em 92,1% (94/102) dos pulmões com coinfecções, seguido de IAV, que foi encontrado em 89,2% (91/102). Além das coinfecções, lesões de IAV foram observadas em mais seis amostras que não aparentavam envolvimento de outro agente infeccioso. Um total de 46 amostras com suspeita de lesão aguda e subaguda de IAV no exame histopatológico foram avaliadas para IHC e RT-PCR em tempo real para IAV e 35% (16/46) delas foram positivas por IHC e 13% (6/46) foram positivas por RT-PCR em tempo real. Com relação a M. hyopneumoniae, 79,3% (119/150) das amostras foram positivas por qPCR e 84,9% (101/119) delas também apresentaram lesões suspeitas de M. hyopneumoniae no exame histopatológico. Os resultados deste trabalho sugerem a importância do IAV como agente causador de pneumonias em suínos de terminação, embora esse vírus seja mais frequentemente relatado na fase de creche. Além disso, os achados deste trabalho demonstram a presença frequente de coinfecções pulmonares em suínos de terminação.(AU)

Aspectos associados à drogarresistência em pessoas com Tuberculose/HIV: revisão integrativa / Aspectos relacionados con la drogorresistencia en personas con tuberculosis/VIH: revisión integradora / Aspects associated with drug resistance in people with tuberculosis/HIV: an integrative review

Resumo Objetivo: Analisar as produções científicas acerca dos aspectos associados à drogarresistência em pessoas com coinfecção Tuberculose/HIV. Métodos: Revisão integrativa de literatura, realizada nas bases de dados CINAHL, LILACS, SciELO, Web of Science, SCOPUS, MEDLINE e COCHRANE. Utilizaram-se dos descritores HIV, Tuberculose e Resistência a múltiplos medicamentos, em português, inglês e espanhol. Encontraram-se 1.177 artigos e selecionaram-se 19, excluíram-se 1.158, 41 duplicados e 1.117, por não atenderem à pergunta de pesquisa e abordarem outras temáticas, como: coinfecção do HIV e pneumonia; impacto da multirresistência na vida de pessoas com coinfecção, destacando-se a mortalidade; testes diagnósticos de multirresistência aos fármacos; e associação entre HIV e tuberculose meníngea. Resultados: Os dados obtidos foram organizados em três categorias temáticas: Aspectos clínicos, destacando-se: infecção pelo HIV, hipoalbuminemia, carga elevada do bacilo; Aspectos relacionados aos fármacos, incluindo abandono do tratamento, não adesão à terapia, tratamento prévio para tuberculose, má absorção de medicamentos, efeitos adversos causados pela terapia antirretroviral, interação entre os tratamentos de ambas as infecções; e Aspectos sociais, sinalizando-se hospitalizações, convivência com outras pessoas com bacilos multirresistentes, privação de liberdade, atraso no diagnóstico e início tardio do tratamento. Conclusão: Os principais aspectos identificados foram o abandono da terapêutica, tratamento prévio para tuberculose e intervenção inadequada, tais resultados, também, podem estender-se às pessoas que não apresentam coinfecção. Enfatiza-se a importância desta revisão para instigar novas pesquisas, com destaque para estratégias com foco na identificação precoce de pessoas com multirresistência, prevenção e incentivo à adesão ao tratamento.

Resumen Objetivo: Analizar las producciones científicas sobre los aspectos relacionados con la drogorresistencia en personas con coinfección tuberculosis/VIH. Métodos: Revisión integradora de literatura, realizada en las bases de datos CINAHL, LILACS, SciELO, Web of Science, SCOPUS, MEDLINE y COCHRANE. Se utilizaron los descriptores VIH, tuberculosis y resistencia a múltiples medicamentos, en portugués, inglés y español. Se encontraron 1.177 artículos, de los que se seleccionaron 19 y se excluyeron 1.158, 41 duplicados y 1.117 por no abordar la pregunta de la investigación y tratar otros temas, como: coinfección de VIH y neumonía; impacto de la multirresistencia en la vida de personas con coinfección, con énfasis en la mortalidad; pruebas diagnósticas de multirresistencia a los fármacos, y relación entre VIH y tuberculosis meníngea. Resultados: Los datos obtenidos fueron organizados en tres categorías temáticas: aspectos clínicos, con énfasis en: infección por VIH, hipoalbuminemia, carga del bacilo elevada; aspectos relacionados con los fármacos, como abandono del tratamiento, no adherencia al tratamiento, tratamiento previo para tuberculosis, mala absorción de medicamentos, efectos adversos causados por el tratamiento antirretroviral, interacción entre los tratamientos de ambas infecciones; y aspectos sociales, con foco en internaciones, convivencia con otras personas con bacilos multirresistentes, privación de la libertad, retraso en el diagnóstico e inicio tardío del tratamiento. Conclusión: Los principales aspectos identificados fueron el abandono del tratamiento, el tratamiento previo para tuberculosis y la intervención inadecuada. Estos resultados también pueden extenderse a las personas que no presentan coinfección. Se resalta la importancia de esta revisión para estimular nuevas investigaciones, con énfasis en estrategias centradas en la identificación temprana de personas con multirresistencia, prevención e incentivo para adherir al tratamiento.

Abstract Objective: To analyze scientific productions on aspects associated with drug resistance in people with tuberculosis (TB)/HIV coinfection. Methods: Integrative literature review performed in the CINAHL, LILACS, SciELO, Web of Science, SCOPUS, MEDLINE and COCHRANE databases. The following descriptors were used in Portuguese, English and Spanish: HIV, Tuberculosis and Multidrug resistance. In total, 1,177 articles were found and 19 were selected; 1,158 were excluded, of which 41 were duplicates and 1,117 did not answer the research question and addressed other topics, namely: HIV and pneumonia coinfection; impact of multidrug resistance on the lives of people with coinfection, with emphasis on mortality; diagnostic tests for multidrug resistance; and association between HIV and meningeal tuberculosis. Results: Data were organized into three thematic categories, as follows: Clinical aspects, highlighting: HIV infection, hypoalbuminemia, elevated bacillus load; drug-related aspects, including treatment abandonment, non-adherence to therapy, previous treatment for tuberculosis, drug malabsorption, adverse effects caused by antiretroviral therapy, interaction between treatments for both infections; and social aspects, including hospitalizations, living with other people with multidrug-resistant bacilli, deprivation of liberty, delayed diagnosis and late start of treatment. Conclusion: The main aspects identified were abandonment of therapy, previous treatment for tuberculosis and inadequate intervention, and these results may also extend to people who do not have coinfection. This review is important to instigate new research, with emphasis on strategies focused on the early identification of people with multidrug resistance, prevention and encouragement of adherence to treatment.

Gravidade das coinfecções virais em lactentes hospitalizados com infecção por vírus sincicial respiratório / Severity of viral coinfection in hospitalized infants with respiratory syncytial virus infection

OBJETIVO: Comparar a gravidade de infecções causadas por um único vírus (VSR) com a gravidade de coinfecções. MÉTODOS: Este estudo avaliou uma coorte histórica de lactentes com infecção aguda por VSR. Secreção de nasofaringe foi coletada de todos os pacientes rotineiramente para pesquisa viral usando técnicas de biologia molecular. Os seguintes desfechos foram analisados: tempo total de internação, duração da oxigenioterapia, admissão em unidade de terapia intensiva e uso de ventilação mecânica. Os resultados foram ajustados para os fatores confundidores (prematuridade, idade e aleitamento materno). RESULTADOS: Foram incluídos no estudo 176 lactentes com idade média de 4,5 meses e diagnósticos de bronquiolite e/ou pneumonia. Cento e vinte e um tinham infecção única por VSR, e 55 tinham coinfecções (24 VSR + adenovírus, 16 VSR + metapneumovírus humano e 15 outras associações menos frequentes). Os quatro desfechos de gravidade avaliados foram semelhantes entre o grupo com infecção única por VSR e os grupos com coinfecções, independente do tipo de vírus associado com o VSR. CONCLUSÃO: As coinfecções virais não parecem alterar o prognóstico de lactentes hospitalizados com infecção aguda por VSR.

OBJECTIVE: To compare the severity of single respiratory syncytial virus (RSV) infections with that of coinfections. METHODS: A historical cohort was studied, including hospitalized infants with acute RSV infection. Nasopharyngeal aspirate samples were collected from all patients to detect eight respiratory viruses using molecular biology techniques. The following outcomes were analyzed: duration of hospitalization and of oxygen therapy, intensive care unit admission and need of mechanical ventilation. Results were adjusted for confounding factors (prematurity, age and breastfeeding). RESULTS: A hundred and seventy six infants with bronchiolitis and/or pneumonia were included in the study. Their median age was 4.5 months. A hundred and twenty one had single RSV infection and 55 had coinfections (24 RSV + adenovirus, 16 RSV + human metapneumovirus and 15 other less frequent viral associations). The four severity outcomes under study were similar in the group with single RSV infection and in the coinfection groups, independently of what virus was associated with RSV. CONCLUSION: Virus coinfections do not seem to affect the prognosis of hospitalized infants with acute RSV infection.

Intestinal lesions in pigs affected with postweaning multisystemic wasting syndrome / Lesões entéricas em suínos afetados por síndrome multissistêmica do definhamento dos suínos

Samples of mesenteric lymph nodes and intestines from 79 unthrifty 3- to 5-month-old postweaning pigs, confirmed as naturally affected with postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS), were studied. Pigs originated from 12 farms in southern Brazil and were selected on the basis of clinical signs and/or gross lesions suggestive of enteric disorder. Lymphohistiocytic infiltrates of varying intensity were associated with anti-porcine circovirus type 2 (anti-PCV2) immunostaining (IS) in samples of intestines and mesenteric lymph nodes from all pigs. Although most findings were similar to those described in PCV2-associated enteritis, anti-PCV2 IS in association with depletion of the goblet cell mucin stores (24 pigs), diffuse ileal villous atrophy and fusion (18 pigs), and dilatation of the lymphatic vessels (11 pigs) combined or not with lymphangitis were also observed. PCV2 antigen was immunohistochemically demonstrated in the cytoplasm and nuclei from intralesional epithelial cells, histiocytes, and endothelial-like cells in intestinal tissues. Together these findings imply an association with PCV2. The presence of co-infections by Lawsonia intracellularis, Brachyspira spp., Mycobacterium spp., Salmonella spp., rotavirus, parvovirus, coronavirus and enteric calicivirus with PCV2 in the intestinal lesions was investigated.

Amostras de linfonodos mesentéricos e intestinos de 79 leitões desmamados refugos, entre 3 e 5 meses de idade e confirmados como naturalmente afetados pela síndrome multissistêmica do definhamento foram estudadas. Os suínos eram oriundos de 12 criações no sul do país e foram selecionados em função dos sinais clínicos e/ou lesões macroscópicas sugestivos de doença entérica. Infiltrados linfoistiocíticos de intensidades variáveis foram associados com marcação positiva anti-circovirus suíno tipo 2 (anti-PCV2) em amostras de intestinos e linfonodos mesentéricos de todos os 79 animais. Embora a maioria dos achados fossem semelhantes aos descritos em enterite associada com PCV2, marcação imuno-histoquímica anti-PCV2 foi associada com depleção de células caliciformes (24 suínos), atrofia e fusão de vilosidades do íleo (18 suínos) e dilatação de vasos linfáticos (11 suínos) combinada ou não com linfangite. Antígenos de PCV2 foram demonstrados por imuno-histoquímica no citoplasma e núcleo de células epiteliais intralesionais, histiócitos e células tipo endotelial em tecidos intestinais. Em conjunto, esses resultados sugerem que as lesões estavam associadas com PCV2. A presença de co-infecções por Lawsonia intracellularis, Brachyspira spp., Mycobacterium spp., Salmonella spp., rotavírus, parvovírus, coronavírus e calicivírus entérico com PCV2 nas lesões intestinais foi investigada.